Introduction générale : taxinomie

INTRODUCTION GENERALE : TAXINOMIE

L'homme a toujours eu le besoin de tous classer. Les êtres vivants n'échappent pas à cette règle. En biologie, l'art de classer se nomme la systématique. L'art de décrire, d'identifier, de nommer se nomme la taxinomie. (également écrit "taxonomie"). Aujourd'hui, les deux termes se confondent. La classification des êtres vivants correspond à la systématique et à la taxinomie. Personnellement, j'utiliserais le terme de taxinomie.

    De nombreuses classifications ont existées, existent, existeront.... Aujourd'hui, deux classifications s'affrontent. La première, celle que j'utilise, est la plus ancienne. C'est la classification dite "classique". La deuxième, toute jeune, est dite "classification phylogénétique". Elle se base sur l'étude des gènes. Et c'est la pagaille ! Les taxinomistes se tapent dessus pour savoir ou placer tel ou tel être vivant.... et c'est celle qui est enseignée dans les collèges....

    La classification classique est organisée en rangs, appelés taxons. Ils sont comme des tamis : ils filtrent selon des caractères communs : ainsi le phylum des arthropodes filtre les animaux ayant un exosquelette et des pattes articulées et le sous-phylum des hexapodes filtre les arthropodes possédant 6 pattes. Chaque niveau va en s'affinant.
    Les taxons s'écrivent en latin. Il est néanmoins possible de les franciser (pour les principaux). La manière dont est écrit un taxons peut aider à déterminer son niveau taxinomique. Les noms latins ne prennent pas d'accent !

Voici les taxons (en rouge les principaux) :

TAXON	CARCTERISTIQUES
Règne	C'est le plus haut niveau de classification taxinomique Commence par une majuscule On peut le franciser
Sous-règne	Commence par une majuscule On peut le franciser
Phylum	Commence par une majuscule On peut le franciser S'écrit phyla au pluriel, également appelé embranchement
Sous-phylum	Commence par une majuscule On peut le franciser S'écrit sous-phyla au pluriel, également appelé sous-embranchement
Classe	Commence par une majuscule On peut la franciser Les classes sont plus homogènes que les taxons précédents
Sous-classe	Commence par une majuscule On peut la franciser
Infra-classe	Commence par une majuscule On peut la franciser
Ordre	Commence par une majuscule, se finit en -a (attention, d'autre taxons se finissent également par -a) On peut le franciser L'ordre fait un peu de tri dans la classe
Sous-ordre	Commence par une majuscule On peut le franciser
Infra-ordre	Commence par une majuscule On peut le franciser
Super-famille	Commence par une majuscule, se finit en -oidea On ne peut pas le franciser
Famille	Commence par une majuscule, se finit en -idae (prononcer idé) On peut le franciser
Sous-famille	Commence par une majuscule, se finit en -inae (prononcer iné) On ne peut pas le franciser
Tribu	Commence par une majuscule, se finit en -ini On ne peut pas le franciser
Sous-tribu	Commence par une majuscule, se finit en -ina On ne peut pas le franciser
Genre	Commence par une majuscule, s'écrit en italique On peut le franciser Les êtres vivants appartenant au même genre sont souvent proche morphologiquement
Sous-genre	Commence par une majuscule, s'écrit en italique, entre parenthèse après le genre On ne le francise pas
Espèce	Commence par une minuscule, s'écrit en italique, toujours précéder du genre On peut le franciser
Sous-espèce	Commence par une minuscule, s'écrit en italique, après l'espèce On peut le franciser

(si vous trouvez sa difficile je vous déconseille la classification phylogénétique...)

    Les espèce sont toujours désignées par deux mots : le nom du genre + le nom de l'espèces. C'est ce que l'on appelle la nomenclature binomiale. Le genre peut être suivis d'un sous-genre, et l'espèce d'une sous-espèce mais ce n'est pas obligatoire, c'est surtout pour plus de précision. Un exemple facile : l'homme Homo sapiens Linnaeus 1758, famille des Hominidae. Homo identifie le genre et sapiens l'espèce.
    Vous avez sans doutes remarqué que j'ai ajouté un nom après l'espèce, ainsi qu'une date. C'est le nom du descripteur, la personne qui à décrit pour la première fois l'espèce, et l'année est l'année de la description. Lorsque le nom du descripteur est entre parenthèse, c'est que l'espèce a changée de genre. Lorsque l'espèce à été décrite plusieur fois, c'est le nom du descripteur le plus ancien qui est gardé. C'est la loi de l'antériorité. Le nom du descripteur peut être francisé (Linnaeus donne Linée) et commence toujours par une majuscule. La date de la description est toujours une année.
    Pour ceux qui n'aurait pas le cerveau ramolis par Internet, vous aurez remarqué que l'homme Homo sapiens, donc nous, n'a été décrite qu'en 1758 ! Pourquoi pas avant ? Essayez de trouver, la réponse est en bas de page.

    Mais pourquoi s'embêter d'un tel système pour nommer les êtres vivants. Un homme c'est un homme, un chien c'est un chien ! Parce que c'est un système mondial. Ainsi, les noms courants (= noms vernaculaires) pour désigner les êtres vivants change de pays en pays, pire : de région en région, alors que les noms scientifiques restent partout les mêmes.

Maintenant les abréviations (attention, votre torture n'est pas encore finis !!) :

ABREVIATION	ABREVIATION DE	SIGNIFICATION
gr.	groupe	lorsqu'au sein d'un même genre un groupe de plusieurs espèces sont tellement proche qu'on ne peut pas les distinguer (sauf par l'étude des organes génitaux) on met après le genre l'abréviation suivis du nom d'une espèce représentative du groupe. Placé après un genre et suivis par l'espèce Exemple : Tegenaria gr. atrica (le groupe atrica comprend 3 espèces de Tégénaire : atrica, saeva et duellica)
cf.	confer	Signifie "qu'on a sans doutes à faire à" Se place après un genre et avant une espèce Exemple : Dolomedes cf. fimbriatus indique qu'on a à faire à une Dolomedes, sûrement fimbriatus
sp.	species	Lorsque l'on connaît le genre, mais pas l'espèce, on met l'abréviation après le nom du genre. Exemple : Carabus sp.
spp.	species plurima	placé après un genre, il signifit qu'on parle de toute les espèces dudit genre Exemple : Araneus spp.
ssp.	subspecies	sous-espèces Exemple : Carabus morbillosus -ssp alternans -ssp constantinus -ssp macilentus -ssp morbillosus
Abréviation de genre	Abréviation de genre	Une fois qu'on a cité une espèce, on peut abréger son genre Exemple : une fois qu'on a cité Tegenaria campestris, on peut dire T. campestris

Mais qui a inventé ce système ? C'est un naturaliste suédois du XVIIIème siècle, Carl von Linnaeus -Carl von Linnée en français- (ça ne vous dit rien ?) qui a jeté les bases de la taxinomie moderne. Il écrivit un livre, après avoir voyagé en Europe, Systema Naturae, édité plus de 10 fois, et dont la dixième édition de 1758 (si ça ne vous dit rien c'est que vous avez le cerveau ramolit) généralise le système de nomenclature binomiale.

Classification taxinomique simplifié des arthropodes jusqu'aux ordres (en rouge, classes et ordres qui sont ou seront traités par le site) :

PHYLUM	SOUS-PHYLUM	CLASSE	ORDRE
Arthropoda (Arthropode)	Chelicerata (Chélicérate)	Arachnida (Arachnide)	Araneae Opiliones Scorpiones Pseudoscorpionnes Palpigradi Acari Amblypygi Uropygi Solifugae Ricinulei Schizomida
		Pycnogonida (Pycnogonide)	Pantopoda
		Merostoma (Mérostomate)	Xiphosura
	Crustacea (Crustacé)	Branchiopoda (Branchiopoda)	Diplostraca Notostraca Anostraca
		Cephalocarida (Céphalocaride)
		Malacostraca (Malacostracé)	Isopodes Decapoda
		Maxillopoda (Maxillopode)
		Ostracoda (ostracode)
		Remipedia (Rémipede)
	Hexapoda (Hexapode)	Insecta (Insectes)	Coleoptera Diptera Hemiptera Hymenoptera Ephemeroptera Lepidoptera Archaeognatha Zygentoma Odonata Plecoptera Blattodae Dictyoptera Isoptera Dermaptera Phasmatodea Orthoptera Embioptera Psocoptera Phthiraptera Thysanoptera Megaloptera Raphidioptera Neuroptera Strepsiptera Mecoptera Siphonaptera Trichoptera
	Hexapoda (Hexapode)	Entognatha	Collembola Diplura Protura
	Myriapoda (Myriapode)	Chilopoda (Chilopode)	Scutigeromorpha Scolopendromorpha Lithobiomorpha Géophilomorpha
		Diplopoda (Diplopode)	Glomérida Polydesmida Julida
		Pauropoda (Pauropode)
		Symphyla (Symphyle)